Né près de Québec, Alain Perron a fait ses études en hautbois et en composition à Trois-Rivières et à Québec. Il a obtenu sa maîtrise en 1989 à l'Université Laval dans la classe de François Morel. Ayant obtenu une bourse du Canada et une bourse du Québec, il poursuit ses études de doctorat en Pologne avec Krzysztof Penderecki et Marek Stachowski. En 1989, il s'est mérité le Premier Prix de composition Sir Ernest MacMillan pour son œuvre d'orchestre Dorléac. Son œuvre Séquences voilées pour orchestre a remporté le Premier Prix de composition du New Music Festival du Maurier Arts Ltd 1993 à Winnipeg. Cette œuvre a également été enregistrée sur disque compact avec l'Orchestre Symphonique de Winnipeg. Alain Perron a de plus été sélectionné par la Vienna Masters qui a enregistré Séquences voilées et Double éclat avec l'orchestre de la radio de Cracovie en Pologne.